ادامه بیو تکنولوژی۲

ميكروبيو لوژي صنعتي و فرآيند هاي تخميري

    Industrial Microbiology and Fermentation Processes 

 

تعداد واحد عملي: -

حل تمرين:-

تعداد واحد نظري: 2

نوع درس: اصلي

مقطع: كارشناسي ارشد بيوتكنولوژي  

 

هدف درس:

فراگيري کاربردهاي ميكروبيولوژي صنعتي و فناوري تخمير و درک جنبه هاي نظري حاكم بر آن

 

رئوس مطالب:

1- معرفي فرآيندهاي تخميري: تاريخچه، گستره فرآيندهاي تخميري، توسعه زماني صنعت تخمير، مراحل و بخشهاي اصلي و فرعي ‏فرآيند تخمير

2- جداسازي و نگهداري ميكروارگانيسم: روشها و معيارهاي جداسازي ميكروارگانيسمهاي صنعتي، روشهاي نگهداري ميكروارگانيسمهاي صنعتي

3- توسعه مايه تلقيح براي تخمير صنعتي: روشهاي توسعه تلقيح باکتريايي، روشهاي توسعه تلقيح مخمرها، روشهاي توسعه تلقيح ميسليومي

4- محيط كشت براي تخمير صنعتي: محيط كشت نمونه، فرمولاسيون محيط كشت، منا بع انرژي، منابع کربن، عوامل موثر در انتخاب منابع، مواد معدني، افزودنيها، پيش سازها، تقاضاي اكسيژن، کف کردن و کاربرد      ضد کف

5- معرفي انواع کشت براي تخمير صنعتي: کشت غوطه ور: کشت غير مداوم، کشت غير مداوم خوراک دهي شده، کشت مداوم، کشت حالت جامد و روابط آن، مزايا و معايب کشت حالت جامد نسبت به کشت       غوطه ور

6- استوكيومتري جرم و انرژي در سيستمهاي زيستي: خصوصيات واكنشهاي متابوليكي، مسيرهاي  متابوليكي، تنفس و انتقال الكترون، فتوسنتز، بيوسنتز، انتقال مواد از غشاي سلولي، تنظيم كنندگي متابوليكي، محصولات متابوليسم

7- مروري بر ميکروبيولوژي نفت: تاريخچه، معرفي ميکروارگانيسمها، کاربرد برخي از ميکروارگانيسمها  و محصولات زيستي در صنعت نفت

8- مروري بر برخي فرآيند هاي تخميري: برخي از اين فرآيند ها عبارتند از: توليد الکل، توليد سرکه، توليد پروتئين تک ياخته، توليد داروها نظير پروتئين داروها، آنتي بيوتيکها  و غيره

 

روش ارزيابي:

پروژه

آزمون نهايي

ميان ترم

ارزشيابي مستمر

-

+

-

+

 

بازديد: -

 

منابع اصلي:

 

1� P.F. Stanbury, A. Whitaker, S.J. Hall, "Principles of Fermentation Technology",

     Pergamon Press, Oxford, 1995.

2- J.E. Bailey, D.F. Ollis, "Biochemical Engineering Fundamentals", Mc Graw-  

    Hill, New York, 1995.

3- M.J. Waites, N. Morgan, J.S. Rockeg, G. Higton, "Industrial Microbiology",

     Blackwell Publisher, 2001.

4- E.M.T. Mansi, C.F.A. Bryce, "Fermentation Microbiology & Biotechnology",

    Taylor & Francis Publisher, 1998

 

 

 

      فناوري آنزيم

Enzyme Technology        

     

تعداد واحد عملي: -

حل تمرين:-

تعداد واحد نظري: 2

نوع درس: اصلي

مقطع: كارشناسي ارشد بيوتكنولوژي  

 

هدف درس:

کسب شناخت دقيق از مشخصات فيزيكي و شيميايي آنزيم ها، توليد، خالص سازي، افزايش پايداري آنها، بررسي مختصر سينتيك و كاربردهاي گوناگون آنزيم ها

 

  رئوس مطالب:

1- مشخصات و خواص آنزيمها: تاريخچه، خواص عمومي وكاتاليزوري آنزيمها، طبقه بندي آنزيمها، نامگذاري آنزيمها، جايگاه فعال آنزيم، انواع پيوند در مجموعه آنزيم- ماده اوليه، عوامل عمده در بازدهي كاتاليزوري آنزيمها، آنزيمهاي تنظيمي، زايموژن ها، ايزوزيم ها

2- توليد آنزيمها و خصوصيات آنها: روشهاي مختلف توليد آنزيمهاي درون سلولي و برون سلولي، عوامل موثر بر توليد، ميکرو ارگانيسمهاي توليد کننده

3 � استخراج و خالص سازي آنزيم ها: منابع آنزيمي، استخراج آنزيم ها، سانتريفيوژ، فيلتراسيون، روشهاي شكستن سلولها، كروماتوگرافي

4 � آنزيم هاي تثبيت شده و كاربرد آنها: اهميت تثبيت، روشهاي تثبيت آنزيم، فعاليت آنزيم تثبيت شده، بررسي خصوصييات آنزيم تثبيت شده، كاربرد آنزيم تثبيت شده

5 � استفاده از آنزيم ها در مقياس صنعتي: استفاده از آنزيمها در صنايع شوينده، استفاده از پرو تئازها در چرم سازي،كاربرد آنزيمها در فرايند آبكافت نشاسته، توليد شربت گلوكز، توليد شربتهاي حاوي مالتوز، استفاده از لاكتوز در صنايع لبنيات سازي، استفاده از گلوكز اكسيداز و كاتالاز در صنايع غذايي وكاربردهاي پزشكي آنزيم

6 � استفاده از آنزيم ها در سيستم هاي دو فازي: واكنشهاي آنزيمي، در سيستم هاي دو فازي، پايدار سازي آنزيم ها درسيستم هاي دو فازي، سينتيك آنزيم ها در سيستم دو فازي، مثالهاي عملي استفاده از آنزيم ها در سيستم هاي دو فازي

7- سينتيك آنزيمي: سينتيك واكنشهاي ساده آنزيمي، سينتيك انواع مهارکننده هاي آنزيمي، اثرات دما وpH   در سينتيك واكنشهاي آنزيمي

 

 

روش ارزيابي:

پروژه

آزمون نهايي

ميان ترم

ارزشيابي مستمر

+

+

-

-

 

بازديد: -

 

منابع اصلي:

 

  1- I.H. Seagel, "Enzyme Kinetics",  John Wiley and Sons, New York, 1993.

 2- A. Fersht, "Enzyme Structure and Mechanisms" , Freeman Publisher, 1999.

     3- H.J. Rhem, G. Reed, "Biotechnology", 2nd Edition, John Wiley and Sons, New

       York,1995.

     4- J.E. Bailey, D.F. Ollis, "Biochemical Engineering Fundamentals", Mc Graw-Hill,

         New York, 1986.

 

 

 

فناوري زيست فرآيندها

Technology of Bioprocesses     

 

تعداد واحد عملي: -

حل تمرين:-

تعداد واحد نظري: 2

نوع درس: اصلي

مقطع: كارشناسي ارشد بيوتكنولوژي  

 

هدف درس:

فراگيري مباني فناوري زيست فرآيندها، و بررسي جنبه هاي علمي حاكم بر طراحي راکتورهاي زيستي غوطه ور و حالت

 

 رئوس مطالب:

1- سينتيك رشد ميكروبي: معرفي، مدلهاي سينتيکي رشد، كشت غير مداوم، كشت مداوم، مقايسه كشت غيرمداوم و مداوم در فرآيندهاي صنعتي، محصول دهي توده زيستي، محصول دهي متابوليتها، كشت غير مداوم خوراك دهي شده و كاربردهاي آن

2- راکتورهاي زيستي و خصوصيات آنها: تقسيم بندي راكتورهاي زيستي از نظر عملياتي، شكل، نحوه همگن سازي و جايگاه كاربرد آنها، راكتورهاي زيستي ناپيوسته، راكتورهاي زيستي نيمه - ناپيوسته، راكتورهاي زيستي پيوسته با جريان همزده، راكتورهاي زيستي پيوسته با جريان پيستوني، راکتورهاي زيستي هوابالابر، راکتورهاي زيستي ترکيبي پيوسته سري يا موازي، مشخصات راكتورهاي زيستي جهت سلولهاي گياهي و حيواني، راكتورهاي زيستي حاوي آنزيم، بزرگنمايي و طراحي راکتورهاي زيستي صنعتي

3- اختلاط و هوادهي در راکتورهاي زيستي: انواع روشهاي اختلاط و هوادهي در راكتورهاي زيستي، طراحي همزن هاي مكانيكي با و بدون هوادهي،  بررسي تأثير خواص سيال بر همزدن و هوادهي، اختلاط غير ايده آل و روابط حاكم برآن

4- سترون سازي:معرفي سترون سازي محيط كشت، طراحي سترون سازي فرآيندهاي غير مداوم، روش ريچاردز براي طراحي سيكلهاي سترون سازي، سترون سازي در مقياس صنعتي، روشهاي سترون سازي غيرمداوم، طراحي فرآيند سترون سازي مداوم، سترون سازي با صافي، سترون سازي هوا، سترون سازي گاز خروجي از فرمانتور، تئوري صافيهاي عمقي، طراحي صافيهاي عمقي

 

روش ارزيابي:

پروژه

آزمون نهايي

ميان ترم

ارزشيابي مستمر

-

+

+

+

 

بازديد: -

 

منابع اصلي:

 

1- M.Shuler, F. Kargi, "Bioprocess Engineering: Basic Concept", Academic Publisher,

    2002.

2- M. Flickinger, S.W. Dew, "Bioprocess Technology", John Wiley and Sons,  

     New York 1999.

    3- K. Riet, H. Tramper, " Basic Bioreactor Design", Marcel Dekker Inc., New

    York,1992.

       4- J.E. Bailey, D.F. Ollis, "Biochemical Engineering Fundamentals", Mc  Graw-Hill, New York, 1986.

       5- E.M.T. El-Mansi, C.F.A. Bryce, "Fermentation Microbiology and Biotechnology",

          Taylor & Francis Publisher, 1998.

 

 

 

جداسازي زيستي

Bioseparation   

 

تعداد واحد عملي: -

حل تمرين:-

تعداد واحد نظري: 2

نوع درس: اصلي

مقطع: كارشناسي ارشد بيوتكنولوژي  

 

هدف درس:

فراگيري روشهاي مناسب استخراج، بازيابي و تخليص محصولات حاصل از  فرآيندهاي زيستي، طراحي و بكارگيري مطلوب آنها در مقياس تجاري

 

رئوس مطالب:

1- جداسازي سلولهاي ميكروبي و مواد جامد: آشنايي با برخي روشها ي جداسازي محصولات درون سلولي و برون سلولي که عبارتند از: صاف كردن، ته نشين سازي، سانتريفوژ كردن، جداسازي هاي غشايي

2- روشهاي پاره کردن غشاي سلولي: برخي از اين روشها عبارتند از: روشهاي مكانيكي، روشهاي فيزيكي، روشهاي شيميايي، روشهاي آنزيمي

3- تغليظ محصولات حاصل از تخمير: آشنايي با روشهاي تغليظ محصولات زيستي نظير استخراج مايع- مايع، استخراج جامد- مايع، جذب سطحي،  الكترودياليز و فرايندهاي غشايي

4- تخليص محصولات حاصل از تخمير:

 آشنايي با برخي از روشهاي تخليص مواد و محصولات زيستي نظير: رسوب سازي، انواع روشهاي كروماتوگرافي، روش الکتروفورز

5-  مراحل نهايي آماده سازي محصولات: آشنايي با روشهاي متبلور سازي، خشک کردن انجمادي، بسته‌بندي و کنترل کيفي محصولات زيستي

 

روش ارزيابي:

پروژه

آزمون نهايي

ميان ترم

ارزشيابي مستمر

-

+

+

-

 

بازديد: -

 

 

منابع اصلي:

 

1� P.A. Belter, and E.L.Cussler, "Bioseparations: Downstream Processing for 

     Biotechnology", John Wiley and Sons, 1988.   

2� E. Goldberg, "Handbook of Downstream Processing", John Wiley and Sons,  

     1997.

3 � M.R. Ladisch, "Bioseparations Engineering: Principles, Practice and Economics",

      John Wiley and Sons, 2001.

           4� M. Moo-Young, "Comprehensive Biotechnology", Pergamon Press, 1985.

         5- J. Krijgsman, "Product Recovery  in Bioprocess Technology", Butterworths

             Heinemann Publisher, 1992.

 

 

 

سمينار

Seminar

 

تعداد واحد نظري: 1

تعداد واحد عملي: -

حل تمرين: -

مقطع: كارشناسي ارشد بيوتكنولوژي  

نوع درس: اصلي

 

هدف درس:

    آمادگي دانشجو براي انتخاب موضوع تحقيق پروژه کارشناسي ارشد

 

 رئوس مطالب:

 يکي از حوزه هاي بنيادي يا کاربردي زير با راهنمايي استاد راهنما جهت ارايه سمينار انتخاب مي شود:

1-     بيوتکنولوژي ميکروبي

2-     نانوبيوتکنولوژي

3-     بيوتکنولوژي محيط زيست

4-     بيوتکنولوژي پزشکي و دارويي

5-     بيوتکنولوژي صنعتي و معدن و غيره

 

روش ارزيابي:

پروژه

آزمون نهايي

ميان ترم

ارزشيابي مستمر

+

-

-

+

بازديد: -

 

منابع اصلي:

مراجع مورد استفاده مقالات مرتبط با موضوع در مجلات پژوهشي معتبر و كتب مرتبط مي‌باشند كه توسط استاد مربوط معرفي مي‌گردد. برخي از مجلات علمي قابل استفاده عبارتند از:

 

1-     Journal of Biotechnology

2-     Journal of Biotechnology Advances

3-     Journal of Applied Microbiology

4-     Journal of Biotechnology Letters

 

 

نانوبيوتکنولوژي

          Nanobiotechnology   

 

تعداد واحد عملي: -

حل تمرين:-

تعداد واحد نظري: 2

نوع درس: اختياري

مقطع: كارشناسي ارشد بيوتكنولوژي   

 

هدف درس:

فراگيري و شناخت دقيق مواد در مقياس نانو و بکارگيري فرآيند هاي زيستي براي توليد و کاربرد آنها

 

رئوس مطالب:

 

1-     فراگيري نانوتکنولوژي و اهميت آن

2-     تاريخچه و روند گسترش نانوتکنولوژي

3-     روش ها و ابزارهاي معمول در نانوتکنولوژي

4-     کاربرد نانوبيوتکنولوژي در صنايع غذايي، کشاورزي، پزشکي و غيره

5-     اثرات متقابل سلول و ريز ساختار (Nano Structure)

6-     توليد ريز ذرات (Nano Particle) ميکروبي

7-     لايه اس (مطالعه باکتريهاي توليد کننده اين لايه و خالص سازي آن)

8-      ريز حفره ها (Nano Pores) و مهندسي پروتئين

9-     سيستمهاي ترکيبي زيست مواد و ريز ذرات (Nano Particles)

10-پليمرهاي زيستي در مقياس نانو

11-ريز سيم ((Nano Wire و مطالعه باکتريهاي توليد کننده برق و خالص سازي آن

12- ريز چسب زيستي  (Nano Bioglue)و مطالعه باکتريهاي توليد کننده چسب

13-ريز زيست انرژي(Nano Bioenergy) و مطالعه باکتريهاي توليد کننده انرژي

14-مطالعه باکتريهاي توليد کننده واکوئل غني از آهن

15-ريزموتورهاي زيست ملكولي و نقش آنها در مهندسي محيط زيست

16-چشم اندازهاي نوين نانوبيوتکنولوژي

 

روش ارزيابي:

پروژه

آزمون نهايي

ميان ترم

ارزشيابي مستمر

-

+

-

-

 

بازديد: -

 

 

منابع اصلي:

 

1- ر. کسري کرمانشاهي، ب. حسين خاني، "نانوبيوتکنولوژي از ديدگاه ميکروبيولوژي"، انتشارات دانشگاه اصفهان، 1386.

2- C.M. Niemeyer, C.A. Mirkin, " Nanobioechnology: Concept, Applications and

    Prospectives", Wiley-VCH, Weinheim,  2004

3- A. Kumar, S.S.R. Challa, "Nanotechnologies for the Life Sciences", Wiley-                          

    VCH,

    Weinheim, 2007.

 

 

 

      زيست فناوري محيط زيست

Environmental biotechnology         

     

تعداد واحد عملي: -

حل تمرين:-

تعداد واحد نظري: 2

نوع درس: اختياري

مقطع: كارشناسي ارشد بيوتكنولوژي  

 

هدف درس:

فراگيري جنبه هاي علمي و نظري حاکم بر فرآيندهاي مورد استفاده در زيست فناوري محيط زيست

 

  رئوس مطالب:

1- مباني ميكروبيولوژي محيط زيست: معرفي ميکروارگانيسمهاي محيط زيست، عملکرد و شرايط آنها در محيط زيست

2- کاربرد راكتورهاي زيستي در محيط زيست: معرفي انواع راکتورهاي زيستي کاربردي در محيط زيست، مزايا و معايب آنها، معادلات حاکم بر برخي از آنها

3- فيلم زيستي و کاربرد در محيط زيست: معرفي زيست فيلم، عوامل موثر در تشکيل فيلم زيستي، مکانيزم تشکيل و تخريب فيلم زيستي

4- زيست پالايش خاك و آب آلوده: معرفي زيست پالايش،  انواع راهبردهاي زيست پالايش، عوامل موثر در زيست پالايش، مزايا و معايب زيست پالايش نسبت به ساير روشها

5- تبديل زيستي آلاينده ها و مواد مقاوم سمي در محيط زيست: معرفي مواد مقاوم در برابر زيست تخريب پذيري، نحوه زيست پالايش ترکيبات مقاوم  در برابر زيست تخريب پذيري، مکانيزم تخريب ترکيبات شيميايي مقاوم

6- تصفيه  زيستي گازهاي خروجي: بررسي روشهاي حذف زيستي گازهاي آلاينده، مزايا و معايب روشهاي زيستي با روشهاي شيميايي

7- توليد محصول زيستي از پساب: توليد پليمرهاي زيستي بر اساس پساب نظير پلي هيدروکسي بوتيرات و غيره

 

روش ارزيابي:

پروژه

آزمون نهايي

ميان ترم

ارزشيابي مستمر

-

+

-

+

 

بازديد: -                  

 

منابع اصلي:

 

1� B.E. Rittmann, "Environmental Biotechnology: Principles and Applications", Mc

    Graw-Hill, New York, 2001.

2- G.M. Evans, J. Furlong, "Environmental Biotechnology: Theory and Applications",

    John Wiley and Sons, 2003.

3- C.F. Forster, "Environmental Biotechnology", John Wiley and Sons, New York,

    1987.

4- R. Mitchell, "Environmental Microbiology, John Wiley and Sons, 1992.

 

 

 

 شيمي‌ فيزيك زيستي

Physical Biochemistry

 

تعداد واحد عملي:

حل تمرين:-

تعداد واحد نظري: 3

نوع درس: اختياري

مقطع: كارشناسي ارشد بيوتكنولوژي  

 

هدف درس:

شناخت دقيق عوامل موثر بر پايداري پروتئين ها و چگونگي پيوند ليگاند به ماکروملکول ها و روش هاي مورد استفاده.

 

 رئوس مطالب:

1- پايداري ساختماني پروتئين‌ها

مقدمه و معرفي مفاهيم اساسي در مبحث پايداري پروتئين‌، نقش نيروهاي غيركووالان در پايداري كانفورماسيوني پروتئين‌ها‌، غيرطبيعي شدن شيميائي پروتئين و معرفي مدل‌هاي مختلف جهت محاسبه ميزان پايداري پروتئين‌، روند تغييرات پارامترهاي طيف‌سنجي پروتئين‌ در طي فرآيند غيرطبيعي شدن و رابطه آنها با تغييرات كانفورماسيوني و ميزان پايداري پروتئين‌، غيرطبيعي شدن گرمائي پروتئين‌ها و معرفي روش‌هاي مختلف تجزيه و تحليل داده‌ها‌، پايداري پروتئين‌هاي اليگومر، نقش پيوندهاي دي‌سولفيدي در ميزان پايداري پروتئين، پايدارسازي ساختمان پروتئين از طريق حلال، جهش‌هاي هدايت شده جهت پايدارسازي ساختار پروتئين

2- پيوند ليگاند به زيست ماكرومولكول‌ها

مقدمه و معرفي مفاهيم اساسي، اهميت پيوند شدن ليگاند در بيولوژي مولكولي و طراحي داروها، معرفي روش‌هاي تجربي مطالعه‌ي پديده‌ي پيوند شدن ليگاند (دياليز تعادلي، روش‌هاي الكتروشيميائي، روش‌هاي طيف‌سنجي، كالري‌متري و ...)‌، منحني‌هاي پيوندي، معرفي مدل‌هاي مختلف ترموديناميكي جهت تجزيه و تحليل منحني‌هاي پيوندي (مدل تك‌جايگاهي‌، مدل مجموعه جايگاه هاي مستقل، مدل مجموعه جايگاه‌هاي كنش‌گر)، منحني‌هاي هيل‌- اسكاچارد و كلودز، معادله ادير، مفهوم تعاوني و مكانيسم مولكولي آن در فرآيند اتصال ليگاند، نقش و اهميت تعاوني در فرآيند اتصال ليگاند، معرفي روش‌هاي محاسباتي جهت محاسبه‌ي پارامترهاي ترموديناميكي پيوند شدن ليگاند و كاربرد آنها درطراحي داروها

3- روش‌هاي رايج در شيمي فيزيک زيستي

1-3- طيف‌سنجي

طيف‌سنجي‌هاي UV-Vis فلورسانس، IR، رامان، NMR و EPR

مباني نظري اين فنون و كاربردهاي ويژه آنها در مطالعه‌ي سيستم‌هاي حياتي به طور كامل شرح داده خواهد شد.

2-3- روش‌هاي هيدروديناميكي

ويسكوزيته(مباني نظري، انواع ويسكومترها و روش تجربه و تحليل داده‌ها)،  روش‌هاي ته‌نشيني(مباني نظري و كاربردها)، الكتروفورز(مباني نظري و كاربردها)

3-3- روش‌هاي گرماسنجي (كالري‌متري):

مباني نظري و عملي كالري‌متري تيتراسيوني همدما (ITC)

مباني نظري و عملي كالري‌متري اسكن تفاضلي (DSC)

مثال‌هاي عملي از كاربرد اين فنون در مطالعه پديده‌هايي همانند پيوند شدن ليگاند، تعيين پايداري پروتئين‌ها و آنزيم‌ها و تعيين سينتيك فرآيندهاي آهسته‌ي زيستي ارائه خواهد شد.

 

روش ارزيابي:

پروژه

آزمون نهايي

ميان ترم

ارزشيابي مستمر

-

+

+

+

 

بازديد: -

 

منابع اصلي:

 

1-     A. Cooper, "Biophysical Chemistry" The Royal Society of Chemistry, 2004.

2-     K.E. Van Holde, W.C. Johnson, P.S. Ho, "Principles of Physical Biochemistry", Prentice Hall Press, NJ, 1998.

3-     D. Sheehan, "Physical Biochemistry: Principles and Applications", John Wiley and Sons, New York, 2000.

4-     T.K. Sauer, J.C. Wang,  Puglisi J. D., "Physical Chemistry: Principles and Applications in Biological Sciences", 4th Edition, Prentice Hall Press, NJ, 2002.

5-     B.A. Shirley, "Protein Stability and Folding", Humana Press, Totowa, New Jersey, 1995.

6-     J. Wyman, S.J. Gill, "Binding and Linkage: Functional Chemistry of Biological Macromolecules", University Science Book, 1990

7-     G.D. Fasman, "Circular Dichroism and the Conformational Analysis of Biomalecules", Plenum, New York, 1997.

8-     J.R. Lakowicz, "Principles of Fluorescence Spectroscopy", Plenum, New York, 1999.

9-     J.E. Ladbury, B.Z. Chowdhry, "Biocalorimetry: the Application of Calorimtry in the Biological Sciences", Willet, New York, 1998.

10-Z.G. Harding, B.T. Chowdhry, "Protein-Ligand Interactions: Hydrodynamics and Calorimetry", Oxford University Press, Oxford, 2001.

 

 

 

 بيوانفورماتيک

Bioinformatics

 

تعداد واحد عملي: -

حل تمرين:-

تعداد واحد نظري: 2

نوع درس: اختياري

مقطع: كارشناسي ارشد بيوتكنولوژي  

 

هدف درس:

دستيابي به توانايي كاربرد كامپيوتر در بيولوژي و بهره مندي از بانك‌هاي اطلاعاتي زيستي

 

 رئوس مطالب:

1- معرفي بانك‌هاي اطلاعاتي بيولوژيكي، بانك‌هاي اطلاعاتي ژنومي، پروتئيني و مراكز بيوانفورماتيك

2- معرفي موتورهاي جستجوگر در بيوانفورماتيك، دستيابي و استخراج اطلاعات ژني ، ژنومي و پروتئيني

3- انواع فرمت‌هاي DNA، ارسال توالي‌هاي DNA و پروتئين به بانك‌ها، تهيه نقشه هاي محدودكننده، اجراي برنامه‌هاي تجزيه و تحليل ترادف‌هاي DNA و پروتئين مثل Blast و Clustalw

4- منابع تهيه نقشه ژنوم ((Genetic and Physical Map Resources و اجراي برنامه نقشه خوان                ( (Map Viewer

5- آشنايي با مفاهيم تجزيه و تحليل توالي‌هاي ژني و اجراي برنامه‌هاي متنوع يابنده هاي ژن  ( (GeneFinding

6- معرفي بانك‌هاي اطلاعاتي مربوط به پروتئين‌ها، تجزيه و تحليل توالي پروتئين‌ها، مدل سازي ملكولي  ( Molecular Modeling)، تعيين ساختار دوم و سوم پروتئين‌ها و تعيين همولوژي

7-  آشنايي با اختراعات ثبت شده((Patent و سازمان‌هاي مربوط

 

روش ارزيابي:

پروژه

آزمون نهايي

ميان ترم

ارزشيابي مستمر

+

+

+

-

 

بازديد: -

 

 

منابع اصلي:

 

1- A.D. Baxevanis,  B.F.  Oueltte "Bioinformatics", John Wiley and Sons, New

    York, 2005.

2- M.R. Barnes,  "Bionformatics for Geneticists", John Wiley and Sons, New

    York,  2003.

3- A.M. Lesk, "Introduction to Bionformatics", Oxford University Press, New

    York, 2002.

 

 

 

تصفيه پساب

  Wastewater Treatment     

 

تعداد واحد عملي: -

حل تمرين:-

تعداد واحد نظري: 2

نوع درس: اختياري

مقطع: كارشناسي ارشد بيوتكنولوژي  

 

هدف درس:

فراگيري مراحل تصفيه پساب و نحوه بكارگيري تجهيزات، فناوريها و فرآيندهاي واحدهاي فيزيكي، شيميايي و زيستي

 

رئوس مطالب:

1-     منابع و خصوصيات پسابها

2-     سرنوشت و اثرات پسابها: توزيع، فارموكينتيك، جذب و دفع پسابها

3-     فرآيند هاي تصفيه اوليه پساب: متعادل سازها، خنثي سازي، انعقاد، رسوب دادن، شناورسازي

4-     فرآيند هاي تصفيه ثانويه پساب: فرآيند تصفيه زيستي لجن فعال، فرآيند فيلم هوازي و غيره

5-     نيتريفيكاسيون و نيترات زدايي (Nitrification and Denitrification)

6-     حذف فسفر و سولفور از پساب

7-     هضم بيهوازي لجن

8-     استخرهاي تثبيت و شرايط آنها

9-     صافيهاي چكنده و ملاحظات

10-جذب سطحي

11-روشهاي حذف فلزات سنگين

12- اكسيداسيون و گندزدايي شيميايي

 

روش ارزيابي:

پروژه

آزمون نهايي

ميان ترم

ارزشيابي مستمر

-

+

-

+

 

بازديد: -

 

منابع اصلي:

 

1- M. Henze, P. Harremoes, J. Cour, E. Arvin, "Wastewater Treatment: Biological and

    Chemical", 3rd Edition, Springer Publisher, 2006.

2� W. Eckenfelder, " Industrial Water Pollution Control", 3rd Edition, McGraw- Hill,

    1989.

3- L. Metcalf,  H.P. Eddy, "Wastewater Engineering: Treatment, Disposal and Reuse",

    3rd Edition, McGraw-Hill, 1991.

 

 

 

اخلاق زيستي

Bioethics

 

تعداد واحد عملي: -

حل تمرين:-

تعداد واحد نظري: 1

نوع درس: اختياري

مقطع: كارشناسي ارشد بيوتكنولوژي

 

هدف درس:

شناخت دقيق جنبه هاي نظري و عملي اخلاق زيستي و التزام به آنها در مراحل مختلف فعاليت هاي علمي

 

 رئوس مطالب:

1- مباني اسلامي اخلاق زيستي (Bioethics) و اخلاق پزشکي (Medical Ethics)

2-  اخلاق پزشکي و اخلاق زيستي در توليد و کاربرد فرآورده هاي زيستي

3- اخلاق در تحقيقات زيستي

4- اهميت اطلاعات ژنتيکي و لزوم محرمانه نگهداشتن آنها

5- مرزهاي اخلاقي ملاحظات ژنتيکي

6- جنبه هاي اخلاقي بيوتکنولوژي توليدمثل

       7- مسايل حقوقي زيست فناوري: حق مالکيت معنوي، پيامدهاي حقوقي دسترسي به اطلاعات ژنتيکي، مسايل حقوقي بيوتکنولوژي توليد مثل، حقوق حيوانات و غيره

8- فقه و علوم زيستي: نگرش فقه به مجموعه حيات، احکام فقهي مرتبط با علوم زيستي، فقه و بيوتکنولوژي

 

 

روش ارزيابي:

پروژه

آزمون نهايي

ميان ترم

ارزشيابي مستمر

-

+

-

-

 

بازديد: -

  

منابع اصلي:

 

1-  م. مطهري،" فلسفه اخلاق "،  انتشارات صدرا، 1376.

2-  م. ا. انيس، "اخلاق پزشکي اسلامي و بيوتکنولوژي"، مجموعه مقالات کنگره بين المللي تاريخ پزشکي در اسلام و ايران، جلد دوم، مشهد 1375.

3-  "اخلاق زيستي (بيواتيک) از منظر حقوقي، فلسفي و علمي"، مجموعه مقالات 1، انتشارات سمت، 1383.

4-  "مجموعه مقالات کنگره بين المللي اخلاق زيستي"، پژوهشگاه مهندسي ژنتيک و زيست فناوري، 1384.

 

5- B.S. Bock, "The Oxford Handbook of Bioethics", Oxford University Press, 2007.